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為因應食品藥物管理局的成立，衛生署擬修正食品衛生管理法，新增條文規定，未經衛生署認可的實驗室，民間單位不得隨意發布食品檢驗結果。對此，消基會抨擊，衛生署此舉無異是向企業傾斜，要求衛生署應廢除該項條文；衛生署則回應，草案內容還有討論空間，會聽取多方意見。
食品衛生管理法自民國64年施行，歷經六次修正，今(99)年5月，因食品藥物管理局成立，衛生署提出修正草案，其中修正草案第四十七條內容指出，民間單位的食品檢驗資訊，若不是經由中央主管機關認可的實驗室檢驗，不得隨意公布。
而經常揭發食品安全問題的消基會，對該項條文相當反彈。今(22)天消基會董事長謝天仁、秘書長黃鈺生等人，特別到衛生署門口舉行記者會，抗議衛生署技術性封殺消基會等民間團體的食品檢驗權，並要求衛生署刪除該項內容，否則消基會絕對抗爭到底。
謝天仁表示，目前國內經衛生署認證的食品衛生檢驗機構共計有36家，由於食品檢驗項目繁多，但這36家檢驗機構被認證的檢驗項目，並無法全部囊括，若該條文通過，食品安全勢必將出現嚴重漏洞。
謝天仁更進一步指出，政府人力無法做到全面檢驗，因此才需要民間團體協助監督。若每項檢驗都需委託政府認證的實驗室進行，花費絕非一般民間團體所能負擔，而且最重要的是檢驗結果正確性，並非實驗室通過認證與否，衛生署此舉只是向企業傾斜，完全罔顧國民的食品安全。
對於消基會的指控，衛生署食品藥物管理局回應，消基會看到的草案是很久以前的內容，而且目前草案都尚有討論空間，衛生署將會聽取多方意見，再做最後定案。
