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99年度個人綜合所得稅申報進入倒數計時，財政部統計到5月24日為止，已經完成申報的件數有312.1萬件，約佔全部申報數的6成，等於有4成還沒申報。申報件數較去(99)年同期間增加51.9萬件，一般申報案件有206萬件，採用稅額試算完成申報的件數有106.2萬件。
一般申報中，採人工填寫申報書完成申報的件數有31.7萬件，二維條碼申報的有8.8萬件，分別佔一般申報案件的15.4％及4.3％，所佔比率均較98年度減少，尤其是人工申報書的部分，比率從20.5％大降至15.4％，二維條碼也從5.5％減至4.3％，網路申報件數比率，則從74％增加到80.3％，從5月1日至24日的一般申報案件中，採網路結算申報的件數有206萬件。
財政部表示，今年申報所得稅最創新的措施，就是稅額試算服務，發出2百萬多份的稅額試算書，已經收到106萬件的回覆確認或完成繳稅，大約有半數適用稅額試算的納稅義務人，都已完成申報；接獲稅額試算書的納稅義務人，只要在5月31日前，完成繳稅或回覆確認，就完成99年度綜所稅的申報。
另外一項便民措施則是查調扣除額項目增加，包括有捐贈、保險費、醫藥及生育費、災害損失、購屋借款利息、身心障礙特別扣除額，以及教育學費特別扣除額等7項。
雖然採人工申報或二維申報的件數已經愈來愈少，但國稅局仍然提供加班收件服務，即日起至5月31日的上班日，中午都加班收件，31日最後截止日當天晚上，加班收件到7點。
