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曾經讓台北市府相當頭疼的中運量捷運系統文湖線，初期因系統不穩造成旅客不便。自99年12月26日，馬特拉電聯車改裝上線營運後，經過8個月的測試期，8月份平均可用度是99.87％，經過評議委員會確認，通過可用度的檢驗，而64折的票價優惠也將在9月中旬取消。
98年7月4日文湖線通車以來，營運初期因為機電系統運算邏輯設計不周延，而造成營運並不穩定，後來又有馬特拉車廂加入營運等種種困難，目前已逐一克服，平均每2.24秒發一班車，載運人口也從初期14萬人增加至將近19萬人。
台北市長郝龍斌表示，文湖線竣工後，台北市達到區區有捷運的目標，而經過極冷的1月和非常炎熱的7月連續8個月的測試，已通過可用度符合高於99%的要求，所以廠商部分可以提報竣工，後續由捷運公司辦理驗收程序。
而自99年3月17日起市府為鼓勵民眾搭乘文湖線，提供64折的優惠。不過，確定在市府辦理相關程序，捷運公司完成票閘口程式修改後，優惠票價就會跟著取消，恢復正常營運票價的期程將進一步對外公布，最快9月中旬即可上路，而持悠遊卡仍享有八折優惠。
民眾對於捷運需求密度高，穩定度需求也相對非常高，因此文湖線原配置的隨車人員，將從測試期間立刻排除故障，轉變為服務員的角色。但是外界認為，增派隨車員將會增加成本支出。
台北捷運公司總經理譚國光表示，在今(100)年5月曾進行統計，隨車人員支出換算平均每位旅客所負擔的成本是1.09元，隨著旅客增加，成本也下降到1.03元，相較於縮短故障可能延誤的時間，增派隨車員對於乘客還是比較有利。
同時，外界也質疑文湖線繞行松山機場，在恢復正常營運票價後，應該要有折扣補貼。對此，譚國光表示，松山機場運量從通車至今已成長將近一倍，顯示捷運路網設計具有前瞻性。而且根據法律規定及國際慣例，大眾捷運採取里程計費，不可能排除部分里程計價。
