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台北市交通局在8月底風光啟用的二代YouBike微笑單車，不僅簡化會員申請手續，擴大服務據點及車輛數，並且宣布提供前30分鐘不限次數、免費騎乘。但新一代YouBike上路才一個星期，卻頻頻出包，有使用者無法感應租借，甚至傳出悠遊卡顯示錯誤，被扣款1,000元。
根據台北市交通局統計，二代YouBike從8月30日正式啟用，共有41站、1,460輛車上線營運，統計至9月5日止，總使用量達14,399輛次，會員註冊人數逾12,000人，由原先每日259輛次成長至3,555次，遠遠超出原設定目標值。
經營團隊認為YouBike出現系統不穩定，原因在於新舊系統還在整合階段，會員前30分鐘免費優惠方案，受到民眾熱烈迴響。營運一週來使用爆量，的確發生資料鏈在3G網路傳輸過程延遲，以及部分機柱韌體的問題，在某些狀況下會有誤判的情形，造成少數使用者的困擾。
YouBike經營團隊總經理劉麗珠表示，將依照這一週來營運情形，調整相關設備設計、修正韌體BUG，以及租賃站車輛的調度，儘速縮短第一階段的學習陣痛期，務必在最短的時間內，讓整套系統更完備，依照市民實際使用的營運曲線，建立台北模式。
台北市交通局表示，若採全面停止營運進行更新，雖可縮短作業期間，但會對信義區的使用者不公平，為使整合期間YouBike服務不中斷，在評估原信義區使用率後，決定採用半半施工方式進行更新作業，並在9月20日前完成系統更新等相關作業。
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