捷運系統是大台北地區民眾最常搭乘的交通工具之一，隨著悠遊聯名卡的推出，更炒熱了使用的需求。尤其當四家發卡銀行陸續加入其他聯名的優惠，企圖衝高發行量之際，對許多人來說，擁有一張悠遊聯名卡搭捷運，不但有優惠、乘車有保障、自動儲值，相當可以滿足捷運一族的需求。
但是，有些卡友卻也發現，悠遊聯名卡還是有一些限制和不便的地方，例如：銀行就規定，如果要退還悠遊聯名卡內儲值金額時，要加收200元不等的手續費，比起悠遊卡可以直接退還，卡友會損失一筆錢。因此銀行也建議卡友，在停用悠遊聯名卡前，一定要先將儲值金額使用完，就可避免手續費的問題。
另外，很多人都會搭乘捷運轉乘公車，悠遊聯名卡採單一票價，悠遊聯名卡雖然也有轉乘的優惠，但所有的優惠都比照普通卡，也就是以悠遊聯名卡轉乘一律都是8元，無法享有學生、軍警、敬老的優惠，雖然對大多數人不造成影響，但是特殊身分的人就喪失轉乘的優惠。
目前四家發行悠遊聯名卡銀行，已經有兩家推出三方聯名卡的優惠，首先推出的台北富邦A POWER悠遊聯名卡，以及最近推出的台新新光三越悠遊聯名卡，增加加油以及百貨的相關優惠。另外兩家尚未推出三方悠遊聯名卡的銀行，預料也會推出新的信用卡，將會讓悠遊聯名卡更具吸引力。
