為消除藥價黑洞疑慮，中央健保局擬明(100)年試辦「藥品費用支出目標」，不過消基會卻認為，此舉不但無法解決藥價黑洞，反而讓醫院藉由開藥來圖利。學者也擔心，藥價一旦採總額管制，民眾藥只會越吃越多，不只造成健保無謂浪費，國人健康更是堪憂。
二代健保尚在審查當中，而藥價黑洞的疑慮始終存在，健保藥費向來佔健保支出的25%。為了節流，健保局有意試辦藥品費用支出目標，也就是俗稱的「藥品總額管制」，預先決定藥品支出預算，若超出目標值，醫療機構須自行吸收，以控制藥價支出的成長幅度。
所謂藥價差，指的就是醫院採購價與健保給付價的差距，而年年劇增的藥價差額，更是健保長期以來的沉重負擔，為求健保永續經營，二代健保的推動刻不容緩，而藥品費用支出目標方案也跟著入法，正是希望能抑制藥價黑洞的擴大。
但是對於藥品總額的推行，消基會抨擊指出，此舉只是把健保總額的餅畫大，因為每年的藥價節餘款，並未從健保總額中扣除，所以每年的健保總額只會越來越高，若以此為基礎訂出藥價支出目標，醫療院所為了衝量，藥只會越開越多，等於是保障醫院靠開藥來圖利。
台北醫學大學藥學系教授王惠珀則表示，根據2008年的資料顯示，國人的平均用藥量是美國的6.6倍，突顯國人用藥浮濫，若是一旦實施藥品總額管制，民眾吃藥會越來越多，屆時不只是健保浪費的問題，就連國人健康都會亮起紅燈。
消基會呼籲，若要訂定藥品總額，就必須先扣除藥價差金額，支出目標才會合理，並輔以合理管理費及給予開藥符合標準的醫療機構獎勵金，另外為維持公平，藥價調查仍有存在的必要，如此藥價才能真正合理。
