凡那比颱風所造成的災情，主要發生在高屏地區，財政部高雄市國稅局及南區國稅局協助村里長辦理里民災損租稅減免申請，合計受理申報的災害損失租稅減免稅額，國稅加地方稅大約5億元，不過已完成的核定金額，目前只有三分之一。
財政部賦稅署表示，國稅局在風災發生之後，成立「災害減免勘查服務小組」，深入44個重災鄉鎮及行政區，協助349個村里長辦理里民災損租稅減免申請，輔導了6萬多名綜所稅納稅義務人及2萬8千多家營利事業，並發簡訊及電子郵件給重災區的納稅義務人，通知租稅減免規定，合計受理申報的災害損失租稅減免稅額，國稅的部分有4億8,256萬，地方稅有1千4百多萬，合計約5億。
申請租稅減免的金額，在國稅的部分，綜所稅1億8,499萬，營所稅2億9,557萬，營業稅147萬，貨物稅53萬，截至10月31日止，已經核定的減免稅額約1億6千萬，僅佔受理金額的三分之一。其中高雄市國稅局已經核定完畢，南區國稅局仍在核定中，預計11月底前可以完成。
此外，地方稽徵機關已核定減免的地方稅，使用牌照稅稅額322萬，房屋稅稅額1,090萬，地價稅額4千元，娛樂稅5萬多，合計達1,428萬元。
至於重創宜蘭及花蓮的梅姬颱風，國稅局已經輔導了126個里，蘇花公路沿線有3個村，納稅義務人都沒有災損。目前宜蘭及花蓮地區已經受理申報的災害損失租稅減免稅額不多，綜所稅僅7件共18萬，營所稅2千5百多萬，但申報時間尚未截止，所以金額還會再增加，預計12月才能統計出結果。
此外，去(98)年對高屏造成重大災情的莫拉克風災，受理災損租稅減免申請的稅額是21億8千多萬，最後核定21億4千多萬，核定比率近乎百分之百。
