自95年啟用的高速公路電子收費系統(ETC)，上路以來爭議不斷，尤其OBU的裝機率年年未達合約標準，高公局卻一再寬限，雖然遠通電收持續祭出新方案，但消基會對此大力抨擊，認為高公局再三給予免責的做法，明顯有護航的嫌疑。
根據「民間參與高速公路電子收費系統建置及營運」的文件資料顯示，99年6月底，遠通電收經營ETC已有3年，平均利用率應達45％，但當時僅36.63％，遠通電收雖祭出車上機OBU降價、通行費打95折、免裝機體驗等方案試圖改善，但即使到了今(100)年，利用率仍不及合約所訂的60％。
對此，遠通電收再向高公局提出改善方案，要求廢棄原本的遠紅外線系統，改用微波系統，利用eTag(電子標籤)取代現有的車上機扣款，小尺寸的eTag僅OK繃大小，不必裝電池即可使用，民眾只要預儲500元通行費，便可免費獲得，預計明(101)年2月上路。
但這種看似用路人免費獲得電子收費機制的好康，消基會抨擊指出去(99)年11月OBU裝機率不足時，遠通電收便曾推出免裝機體驗ETC車道的方案，當時使用人數突破2萬3千人，但12月又降到1萬5千人，之後並未再增加，顯示即便免費使用，用路人使用ETC的意願不見得會提升。
同時對於遠通電收將電子收費系統更新為微波系統，高公局再度給予免責的作法，消基會更是大感不滿，認為高公局一再寬限，明顯有護航的嫌疑。儘管遠通電收聲稱更換系統的成本已超過裁罰金額，造成公司財務大失血，但消基會反斥，營運建置費用業者理應自行吸收。
消基會進一步說明，依據合約每一車次通過ETC收費點時，遠通電收可由過路費中抽取3.4元。以泰山收費站為例，每日平均通過車次約23萬輛，若以1年360天、ETC平均使用率保守以35％估計，預計收益可達9千9百餘萬元，但遠通電收仍大喊虧錢，批評聲浪恐只增不減！
消基會董事長蘇錦霞表示，未來eTag不該延續OBU一車綁一機的做法，由於新微波系統的資訊僅可單向傳輸，因此用路人預儲與扣款的金額無法在通過收費點時立即得知，必須額外查詢，恐造成民眾不便，另外停止人工收費後，由於人事成本降低，應考慮調降高速公路的通行費率。
