悠遊聯名卡自從推出以來，可刷卡、可搭乘大眾交通工具、還具有小額付款等功能，確實相當方便。但是，失卡的問題還是讓民眾擔心不已，這也是悠遊聯名卡無法順利推展的原因之一。
因悠遊聯名卡強調的就是方便性與複合性，餘額不足時可以自動加值，而悠遊錢包的功能更是主打方便性的項目。也由於同屬信用卡與電子錢包，因此連帶提高了失卡的風險，也衍生出卡片到期後，卡片內餘額該如何退還的問題。
以往民眾遺失悠遊卡，通常儲值的錢就無法拿回來，只能自認倒楣。悠遊聯名卡已改善了這項缺點，但因具有信用卡的功能，處理過程較為繁複，必須另外進行掛失的動作。
在掛失手續費用的收取上，四家發卡銀行中，除了台新銀行掛失免手續費，但也規定需要持卡三個月且不限金額刷卡三次者，而台北富邦、國泰世華、中國信託都需要1000元的掛失費用。
在自負額部份，除了台新的白金卡失卡零風險，無需負擔掛失自負額外，其他三家銀行不負擔掛失24小時前的盜刷費用，並且與一般信用卡相同，卡友最高需自負3000元。
遺失卡片後，悠遊聯名卡電子錢包部分如果尚有餘款，民眾不用擔心餘額無法取回，只要等卡片到期後，銀行就會主動把卡片內剩餘的金額在下一期信用卡帳單中退還。如果消費者並沒有遺失卡片，卡片到期後，銀行一樣會主動在下一期信用卡帳單將餘額退還，民眾就大可安心了。
