個人綜所稅結算申報的一般扣除額有兩種，一種是標準扣除額，一種是列舉扣除額，納稅人可以任選對自己最有利的計算方式來申報，只要可以扣除的金額孰多，就是最有利的方式。不過，國稅局提醒納稅人，一旦申報時選定標準扣除額後，當年度就不得再要求變更適用列舉扣除額了。
國稅局表示，納稅人結算申報時，如果未填明要適用列舉扣除還是標準扣除，將一律被認定為是採標準扣除，而採用標準扣除之後，就不能變更為列舉扣除。
國稅局進一步說明，徵納雙方經常因為認知差距，造成誤解，而納稅人最常見的錯誤，就是申報列舉扣除的加總金額，小於標準扣除額。這時候，稽徵機關就會自動幫納稅人改為採標準扣除額申報，讓納稅人少繳點稅，維護納稅人權益。還有，也發生過納稅人是重複列報標準扣除額和列舉扣除額的錯誤情形。
國稅局整理大家在列舉扣除時，經常發生的誤解。捐贈的部分，教育文化公益慈善團體的捐贈金額，不能超過所得總額的20％；至於到寺廟點光明燈、安太歲的收據，是不能列舉為捐贈扣除，因為點燈安太歲，都是相對代價的給付，也就是說，支付金錢給廟宇，是為了請他們幫忙誦經祈福，而非無償捐贈。
保險費列舉扣除的部分，被保險人與要保人必須在同一申報戶內，才符合列舉扣除規定；納稅義務人本人、配偶、直系親屬每人保險費扣除上限是2萬4，不足部分只能以實際金額列報；不過，今年有好消息是，95年度綜所稅開始，全民健保的保費，不算在2萬4的額度內，可以全數扣除。
申報自用住宅購屋借款利息支出，則須先減除在金融機構的存款利息收入後的餘額，才能申報，而且自用住宅購屋借款利息支出與房屋租金支出，僅能二選一。
還沒申報的民眾，可要把握這些原則，才不會報錯稅，也不會發生誤解，造成日後還要補稅的情況。
