悠遊卡不僅可以在北台灣使用，現在還跨越台灣海峽中線，延伸到離島的馬祖，三月底就可以刷悠遊卡了。在馬祖用悠遊卡可以搭乘南北竿的公車，未來還能搭島際間的船舶，連行駛台灣與馬祖之間的台馬輪，也將可接受悠遊卡和悠遊聯名卡。因此，持卡人到馬祖觀光時，將會更加便利。
隸屬福建省連江縣的馬祖，設籍居民只有約9000人，南竿北竿公車總共有18輛。此次在連江縣政府的主動爭取下，預計在今(97)年3月底完成第一階段南竿北竿公車的悠遊卡系統建置，九月也將可完成馬祖地區島際船舶的票證系統建置。
曾經在馬祖當過兵的台北智慧卡公司董事長陳裕璋就表示，馬祖居民有許多人都來台北就業和就學，每到春節往返於北台灣與連江縣的民眾，高達有五千人之多。所以兩地間之票證整合，不但方便了來大台北地區工作、求學的居民，也可促進馬祖的觀光產業。
陳裕璋進一步表示，馬祖位於大陸閩江口，過去是戰略重地，現在是小三通的港口，以後都可以使用悠遊卡悠遊馬祖了。
因為遠在離島的馬祖，也有好鄰居7-11，在南竿有三家，北竿也有一家，所以悠遊卡在當地也可輕鬆加值，不怕儲值金用完無處加值。
悠遊卡自91年9月30日上市以來，包含悠遊聯名卡已發行了1,195萬張，不但可以可作為票證使用，也可作為小額支付的工具，更整合了基隆市、宜蘭地區的票證系統，還能搭乘國道客運往來於中壢與台中地區，使用上相當方便。
據了解智慧卡已與許多業者或縣市洽談中，像是台北縣淡水藍色公路的兩家經營業者，就紛紛接受悠遊卡付費。而台鐵也正在試辦台北、萬華、板橋、樹林四站間的悠遊卡系統，只要台鐵點頭，三、四月就可上線服務。而宜蘭即將在3月29日展開的綠色博覽會，也可使用悠遊卡付費。
在台北智慧卡公司的整合下，「一卡在手，悠遊全台」的目標越來越近，不過串聯全台的高鐵，還有南部的高捷，卻因種種因素，今年恐怕還是沒有通用的機會。
