悠遊卡除了搭捷運、坐公車之外，6月20日開始悠遊卡也可搭火車。只要持有悠遊卡和悠遊聯名卡的民眾，就可以在台北、萬華、板橋、樹林四站，付費搭乘台鐵，此舉讓悠遊卡通全台的目標，又往前進了一大步。
為了配台鐵道入電子票證系統，台北智慧卡公司與台鐵合作，自6月20日到7月底，試辦在台北、萬華、板橋、樹林等四站，可以使用悠遊卡和悠遊聯名卡付費，直接到剪票口刷卡通關，不必再到售票口前大排長龍。
台北智慧卡公司表示，主要是針對不需劃位之通勤列車而設計，並將悠遊卡與現有之單程票結合，除第一階段的四個車站外，從8月1日開始，也將再擴大到基隆到中壢之間的19站。
使用悠遊卡搭乘台鐵時，民眾只要在進站時，先將悠遊卡在驗票機上感應，出站再感應悠遊卡驗票機，就可完成扣款程序，與搭乘捷運的方式相同。
在這四站區間內，除了太魯閣號、觀光列車、團體列車以外，都可「不限車種」以悠遊卡搭乘，但票價則以復興號計價扣款。其中普通與學生是以全票計價，而敬老、愛心及跟隨在後的愛心陪伴卡，可享有半價的優惠。
以目前台北到樹林的車票價格來看，全票最高19元，半票只要10元。若是遇到餘額不足時，可以到試辦悠遊卡區間的各站售票口及補票房加值，而使用悠遊聯名卡通關，則可享有自動加值功能，不必擔心餘額不足。
智慧卡公司指出，目前流量最大的台北車站，入口設有6台感應器，出口也有10台，板橋站則是各4台，應該足夠應付大量的乘客。
不過，民眾也要特別注意，試辦期間悠遊卡只能在限定的區間使用，如果民眾搭乘的範圍超過試辦區間，就只能自行到月台買票，不能使用悠遊卡支付。若是遇票卡故障，也要以台鐵現行購票方式進站乘車或辦理補票。
