立法院財委會初審通過所得稅法部分條文修正草案，配合促產條例98年底落日，營利事業所得稅及個人綜合所得稅，都有調降。其中，營所稅率從25％降為20％之後，稅收損失808億，個人綜所稅3個級距稅率各調降1％後，並提高最低課稅級距的所得淨額上限至50萬後，稅收損失248億。
初審爭議較大的是綜所稅調降的部分，行政院版本是將原本「6％、13％、21％」等3個級距稅率，調降為「5％、12％、20％」，但立委要求提高稅率為5％級距的所得淨額上限，從41萬，提高至50萬，稅收損失從政院版的170億，一下子跳高至284億元。
不論是哪個級距的納稅義務人都受惠，但以所得淨額50至53萬的納稅義務人，獲益最高，可減少30％的應納稅額，而隨著所得淨額愈高，省錢比例愈小，例如，所得淨額409萬者，只能省下1％的應納稅額。
雖然適用5％稅率級距的所得淨額，提高至50萬後，稅收損失較原來41萬時，還增加了78億，但財政部認為，這是可以適度減輕中低所得及薪資所得者的租稅負擔，有助於增進社會公平。
同時，所得稅課稅級距金額，是按照消費者物價指數上漲程度調整門檻，目前是累積漲幅10％才做調整，行政院版是要降至5％即可反應，但被立委再降為3％，即時反應物價狀況，而財政部也認同，認為不會影響稅收。
不過，立委加碼、財政部點頭同意之下的減稅額度，卻減過了頭。財政部評估促產條例落日後，可收回的稅收有1,483億，但是財政部全部的減稅，卻超過了可收回的稅收。
綜所稅提高所得淨額，且調降1％稅率後，稅收損失248億；調降營所稅率，稅收損失808億；四項促產條例保留租稅優惠，稅收損失300億，再加上今年報稅就能用上的扣除額提高，稅收損失216億之後，稅收損失總計1,572億，財政部要倒貼89億元。
