有機農產品標示不清，8月起開罰，祭出重罰後，果然有效，農委會農糧署在全面執行有機農產品標示檢查的第一、二天，不符規定的比例陡降，從原來緩衝期將近7成的不合格率，降至只有5％的產品標示不符規定。
農委會指出，8月1日至2日兩天派員於各縣市檢查市售有機農產品，以及其加工品之標示，經訪查103家商店、檢查675件有機農產品標示結果，初步判定其中34件產品標示未合於規定，不合格率為5%，不合格率大幅下降。標示不合格的34件有機產品，農糧署將函請各縣市政府開罰單。
農糧署表示，他們抽查標示的方式，是購買後查驗，除保留購買後的統一發票做為證明之外，也會拍照存證，再把這些查到的資訊，轉給地方政府進一步確認，之後就會開出罰單給業者。開罰的標準是以產品批號為認定，同一批號的產品在不同商店購買，也會視為是「一件」不合格案開罰。
最常見的標示不合格情形，就是國產品未經驗證、進口產品未經審查，卻在產品上標示有機文字，將依照農產品生產及驗證管理法規定，處6至30萬元罰鍰。
同時，還有品名未標示有機文字、國產品未標示驗證證書字號及使用CAS台灣有機農產品標章、進口品未標示有機標示同意文件字號、未標示原產地及驗證機構名稱等，此類違反者，將處3至15萬元罰鍰。
事實上，有機農產品管理新制從今(98)年元月31日就上路了，但其中標示檢查部分，基於國際經貿及實際業務運作，遲至8月1日才全面執行查處。近半年以來，農糧署持續輔導相關業者改正標示，呼籲經營業者要確認架上的有機農產品及其加工品標示要合於規定，以避免屆期受罰。
此外，農委會公告了18個有機農產品、加工品同等性國家，包括：紐奧及歐盟等等。而消費者及農民都擔心，中國農產品是否會藉由第三國有機認證的名義，偷渡中國的農產品進口。
農糧署強調，18個有機農產品、加工品同等性國家名單中，沒有中國，且中國農產品有834項是禁止進口到台灣，這834項中國農產品就算通過這18個有機同等性國家的驗證機構所驗證，也不得進口。
