今(98)年7月底時，台鐵公開辦理瑞芳－中壢路段招標，外界看好的悠遊卡公司卻默默退出競標，最後由台灣智慧卡公司(台灣通)以低價得標，令外界跌破眼鏡。
今(9)天北市議員質疑其中有政治力操作，對此悠遊卡公司表示，評估過後，認為若低價搶標，將不敷成本，因此並未參與投標；不過，該標案目前尚未正式公告，仍會盡力爭取繼續服務的機會。
悠遊卡公司與台鐵自96年開始合作，試辦基隆到中壢路段，民眾反應普遍良好；在北部的台鐵車站，曾創下最高一天破10萬次使用悠遊卡進出的紀錄，使用比率也達到5成以上，甚至勝過台鐵所發行的磁卡。
原先悠遊卡公司曾公開表示，悠遊卡所能適用的通行路段，預計將於今年暑假時，就可以擴大到北通瑞芳、南往竹南，並且也會參與台鐵辦理的瑞芳－新竹路段標案。但意外的是，悠遊卡卻沒有參與該標案，選擇自動退出，令外界大感訝異。
悠遊卡公司表示，台北市政府持有悠遊卡公司4成的股份，若是像其它民間業者一樣，以低價搶標，預估2年內將虧損約5千萬，會虧掉該公司十分之一的資本額。這樣如同以台北市政府及納稅人的錢補貼台鐵，並不符合公股事業穩健經營的原則，所以在最後一刻決定退出競標。
據瞭解，在投標前，悠遊卡公司就評估過，可能會出現有其它公司以低價搶標，必須以零費率投標，才有勝算。而開標結果顯示，確實有廠商以0.4%超低分費率搶標，若以此案每加值一筆必須支付台鐵0.5%加值手續費來看，一來一往之間，還要倒貼0.1%，等於是一門虧本生意。
悠遊卡公司指出，以目前在台鐵的試辦情況來說，在台鐵使用悠遊卡的持卡人，有近5成在台鐵站內加值，即使在其他加值點加值，該公司也必須支付加值手續費；而悠遊卡為押金制的租用卡片，並非像其它競標業者一樣，可賣斷卡片增加收入，實在不敷成本。
目前該標案仍未正式決標，主要是因為台灣通得標金額低於底價8成，依「採購法」的規定，廠商還需補充說明，台鐵才能對外公告；但是，就算台鐵不接受台灣通所提出的說明，台灣通還是可用提補「差額保證金」的方式取得標案，幾乎可以說是「換定了」。
然而，依合約規定，得標者在正式決標後，須出資在每個台鐵車站人工閘門入口處裝設外接式感應器，並於4個月內完成；而台鐵與悠遊卡公司之間的合約，也將於今年12月底到期，到時恐將出現更換機器的空窗期。
對此，台灣鐵路局副局長張應輝表示，目前已在審核台灣通所提出的補充說明，希望能盡快決標，才能往後續走。不過，基於公共利益的考量，若新得標者無法在12月底合約到期前，將新系統建置完成，期望能與悠遊卡公司協商，繼續提供服務，渡過這段過渡期，以保障民眾的權益。
