採用二維條碼或是人工填寫申報書，但又想在7月底前獲得退稅的民眾，要把握時間，在5月10日以前完成申報，才能享有第一批退稅的優惠待遇，否則過了5月10日，還希望能在第一批退稅，就只能採網路申報方式了。
財政部台北市國稅局表示，98年度綜所稅申報退稅案件，與過去相同，都是分成3批退稅，第一批退稅時間是7月30日前，退稅款就會入帳，第二批是10月29日前入帳，第三批退稅則要等到100年1月20日，才會退稅給納稅義務人。
可以最早拿到退稅款的納稅義務人，必須符合一定資格條件，首先是綜所稅申報是屬於退稅的案件，並且採用網路完成報稅的，或是在5月10日以前，向戶籍所在地的國稅局分局、稽徵所完成申報的二維條碼，或人工申報的退稅案件。
第二批退稅則是5月11日以後到5月31日申報的退稅案件，第三批退稅則是申報為應該繳稅的案件，也自行繳納稅款，但是經國稅局交查後，認為屬於退稅案件，就會列為第三批退稅，退稅時間也最晚，要到明(100)年1月20日。
國稅局不會主動打電話民眾，叫民眾去ATM領退稅，這是詐騙集團的舊手法，但還是會有人上當受騙。國稅局建議，在申報綜所稅的時候，就要提供金融機構存款帳戶，並在申報書上填寫清楚、正確，退稅款將會在時間內，撥入指定帳戶。而且所提供的金融機構帳戶，只要是參與金融資訊連線的金融機構，像是銀行、郵局都可以，外商銀行也沒問題，不過須為新台幣存款帳戶。
國稅局在將退稅款直接撥入指定帳戶之後，還會郵寄綜所稅退稅直接劃撥通知單，通知納稅義務人退稅款已經撥入帳戶。若是沒有填寫利用郵局或金融機構存款帳戶退稅，或指定帳戶無法撥入者，國稅局會開立綜所稅退稅憑單，郵寄給納稅義務人，納稅義務人在收到憑單之後，在兌領期限內向指定金融機構兌領退稅款即可。
